1.氟塑料磁力泵隔离套损坏：氟塑料磁力泵的磁力联轴器是由泵所输送介质冷却的，如果介质中有硬质颗粒，很容易造成隔离套划伤或划穿，有时如果维护方法不当也有可能造成隔离套的损坏，在维护过程中要安照正确的操作方法进行操作。
2.无轴封磁力泵因气蚀而导致的问题：氟塑料磁力泵产生气蚀的原因主要是泵入口管阻大、输送介质气相较多、灌泵不充分、泵入口能头不够等等几个方面的原因。气蚀对泵的危害大，发生气蚀时泵剧烈振动，液力平衡严重破坏，将导致泵轴承、转子或叶轮损坏。这是磁力泵故障发生的常见原因。
3.氟塑料磁力泵无介质输送或输送介质流量小：因无介质输送或输送介质流量小造成轴承干摩，烧碎轴承。磁力泵是由输送介质给滑动轴承提供润滑和冷却的，在没有开入口阀或出口阀的情况下，滑动轴承因无输送介质润滑和冷却而导致损坏。
4.氟塑料磁力泵运行工况波动大而导致的问题：氟塑料磁力泵的轴向力是通过液压均衡方式自动平衡。在实际运行中如果运行参数(入口压力、出口压力)波动大，很容易破坏泵的液力平衡，使滑动轴承承受大的径向和轴向力而导致轴承损坏。
以上几种是氟塑料磁力泵的常见故障，我们在日常操作过程中要安照正确的操作方法进行操作，同时也要对氟塑料磁力泵进行日常的保养工作，才能够让氟塑料磁力泵使用的更加才长久。